當(dāng)下,全球微生物組領(lǐng)域蓬勃發(fā)展,在地球生態(tài)系統(tǒng)和人類(lèi)健康中,微生物組的作用超乎想象。高通量測(cè)序技術(shù)的廣泛應(yīng)用,使我們能夠從全基因組角度研究自然和人體微生物,也使這一領(lǐng)域成為研究熱點(diǎn)。海量數(shù)據(jù)的產(chǎn)生,使得微生物組學(xué)成為一門(mén)真正的大數(shù)據(jù)科學(xué),而數(shù)據(jù)分析、挖掘也成為微生物組學(xué)研究面臨的挑戰(zhàn)和機(jī)遇。
隨著二代測(cè)序技術(shù)的日趨成熟,微生物組研究涉及的樣本量和測(cè)序數(shù)據(jù)量更是快速增加,微生物組大數(shù)據(jù)的收集、存儲(chǔ)、功能挖掘和開(kāi)發(fā)利用,是制約微生物組發(fā)展的核心問(wèn)題。如何加強(qiáng)微生物資源開(kāi)發(fā)應(yīng)用與分析挖掘能力?如何提升微生物資源有效利用和科技創(chuàng)新支撐能力?如何更有效滿足生信開(kāi)發(fā)及可視化分析需求,成為當(dāng)下微生物組研究應(yīng)用技術(shù)轉(zhuǎn)化亟待解決的難題。
助力某國(guó)家級(jí)研究所
搭建科技共享服務(wù)平臺(tái)
榮聯(lián)科技集團(tuán)旗下全資子公司榮聯(lián)云生數(shù)據(jù)科技有限公司(簡(jiǎn)稱(chēng)“云生數(shù)據(jù)”),專(zhuān)注于生物科技與信息技術(shù)深度融合和創(chuàng)新應(yīng)用,在生物基因數(shù)據(jù)的采、存、管、用等方面形成了領(lǐng)先的技術(shù)優(yōu)勢(shì),為醫(yī)療機(jī)構(gòu)、科研高校、衛(wèi)生管理部門(mén)、藥企、生物科技公司等生態(tài)伙伴提供大數(shù)據(jù)平臺(tái)化賦能增值服務(wù)。
微生物數(shù)據(jù)分析平臺(tái)作為云生數(shù)據(jù)自主研發(fā)的一款平臺(tái)類(lèi)產(chǎn)品,致力于解決腸道微生物組學(xué)數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)、計(jì)算、挖掘、共享和轉(zhuǎn)化問(wèn)題,形成一站式數(shù)據(jù)管理、生信分析、操作可視化云平臺(tái),為微生物的篩查、監(jiān)測(cè)、診斷、科研等相關(guān)重大問(wèn)題提供全面分析解決方案。
目前,云生數(shù)據(jù)已與某國(guó)家級(jí)研究所合作,共建國(guó)家科技資源共享服務(wù)平臺(tái),以推進(jìn)微生物領(lǐng)域科技資源向國(guó)家平臺(tái)匯聚與整合,加強(qiáng)微生物資源開(kāi)發(fā)應(yīng)用與分析挖掘,提升微生物資源有效利用和科技創(chuàng)新支撐能力,為科學(xué)研究、技術(shù)進(jìn)步和社會(huì)發(fā)展提供高質(zhì)量的科技資源共享服務(wù)。
(混合云設(shè)計(jì)方案)
三大模式探索
為精準(zhǔn)醫(yī)療提供數(shù)字支撐
除微生物數(shù)據(jù)分析平臺(tái)之外,云生數(shù)據(jù)還將打造細(xì)分領(lǐng)域?qū)I(yè)產(chǎn)品,包括食源性致病菌監(jiān)測(cè)平臺(tái)/一體機(jī)、病原微生物檢測(cè)分析平臺(tái)/一體機(jī)等,以科技助力微生物檢測(cè),通過(guò)微生物數(shù)據(jù)挖掘、食源性致病菌監(jiān)測(cè)、病原微生物檢測(cè)三大模式探索,為精準(zhǔn)診斷和治療提供數(shù)字支撐。
(三大模式探索)
·MR微生物數(shù)據(jù)挖掘:
對(duì)高通量測(cè)序、三代測(cè)序等新興分子檢測(cè)技術(shù)所得的微生物組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行全面系統(tǒng)分析,供未經(jīng)生物信息學(xué)系統(tǒng)培訓(xùn)的科研人員采用主流分析方法,輕松挖掘微生物組學(xué)數(shù)據(jù),包括數(shù)據(jù)處理、統(tǒng)計(jì)分析、功能分析和與公共數(shù)據(jù)集或已知微生物特征進(jìn)行比較。系統(tǒng)全面分析微生物組學(xué)數(shù)據(jù),參考目前主流分析方法和工具,輕松挖掘微生物組學(xué)數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)科研數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)化應(yīng)用和支撐。
·MS食源性致病菌監(jiān)測(cè):
基于高通量測(cè)序數(shù)據(jù),通過(guò)微生物檢測(cè)分析流程和權(quán)威數(shù)據(jù)庫(kù),獲取微生物檢測(cè)后結(jié)果信息,應(yīng)用于進(jìn)出口商品、食品(水)微生物及其致病因子的病原微生物等,通過(guò)食源性致病菌監(jiān)測(cè)產(chǎn)品,助力疾病疫情、食品安全的預(yù)防與監(jiān)控。
·MD病原微生物檢測(cè):
對(duì)DNA/RNA高通量測(cè)序樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,獲得常見(jiàn)細(xì)菌、真菌、病毒等病原微生物的種屬信息,以解決病原診斷的檢出率、時(shí)效性和準(zhǔn)確性等一系列難點(diǎn),讓眾多重癥感染患者及時(shí)得到精準(zhǔn)診斷和治療。
目前,云生數(shù)據(jù)自主研發(fā)的多組學(xué)大數(shù)據(jù)平臺(tái)、精準(zhǔn)醫(yī)療輔助診斷平臺(tái)和生信分析一體機(jī)等產(chǎn)品已成功服務(wù)于科研院所、基因測(cè)序企業(yè)、醫(yī)療機(jī)構(gòu)等近百家國(guó)內(nèi)外客戶(hù)。未來(lái),榮聯(lián)將依托多年的行業(yè)實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),發(fā)揮云生數(shù)據(jù)在生物醫(yī)療行業(yè)的專(zhuān)業(yè)優(yōu)勢(shì),有效支撐我國(guó)微生物組研究,為國(guó)家微生物組計(jì)劃的實(shí)施提供重要支撐。