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本文介紹了GKE Kubernetes MySQL輸入/輸出錯(cuò)誤Ext4Error的處理方法,對(duì)大家解決問(wèn)題具有一定的參考價(jià)值,需要的朋友們下面隨著小編來(lái)一起學(xué)習(xí)吧!

問(wèn)題描述

我在Kubernetes分區(qū)集群上部署了一個(gè)MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)(狀態(tài)集),在Google Cloud平臺(tái)上作為服務(wù)(GKE)運(yùn)行。

分區(qū)群集由類(lèi)型為e2-Medium的3個(gè)實(shí)例組成。

由于以下錯(cuò)誤,MySQL容器無(wú)法啟動(dòng)。

kubectl logs mysql-statefulset-0
2022-02-07 05:55:38+00:00 [Note] [Entrypoint]: Entrypoint script for MySQL Server 5.7.35-1debian10 started.
find: '/var/lib/mysql/': Input/output error

上次查看的事件。

4m57s   Warning   Ext4Error   gke-cluster-default-pool-rnfh   kernel-monitor, gke-cluster-default-pool-rnfh   EXT4-fs error (device sdb): __ext4_find_entry:1532: inode #2: comm mysqld: reading directory lblock 0   40d   8062   gke-cluster-default-pool-rnfh
3m22s   Warning   BackOff     pod/mysql-statefulset-0   spec.containers{mysql}   kubelet, gke-cluster-default-pool-rnfh   Back-off restarting failed container

節(jié)點(diǎn)。

kubectl get node -owide
gke-cluster-default-pool-ayqo   Ready    <none>   54d   v1.21.5-gke.1302   So.Me.I.P   So.Me.I.P    Container-Optimized OS from Google   5.4.144+         containerd://1.4.8
gke-cluster-default-pool-rnfh   Ready    <none>   54d   v1.21.5-gke.1302   So.Me.I.P   So.Me.I.P   Container-Optimized OS from Google   5.4.144+         containerd://1.4.8
gke-cluster-default-pool-sc3p   Ready    <none>   54d   v1.21.5-gke.1302   So.Me.I.P   So.Me.I.P     Container-Optimized OS from Google   5.4.144+         containerd://1.4.8

我還注意到rnfh節(jié)點(diǎn)內(nèi)存不足。

kubectl top node
NAME                            CPU(cores)   CPU%   MEMORY(bytes)   MEMORY%
gke-cluster-default-pool-ayqo   117m         12%    992Mi           35%
gke-cluster-default-pool-rnfh   180m         19%    2953Mi          104%
gke-cluster-default-pool-sc3p   179m         19%    1488Mi          52%

MySQL Mainfest

# HEADLESS SERVICE
apiVersion: v1
kind: Service
metadata:
  name: mysql-headless-service
  labels:
    kind: mysql-headless-service
spec:
  clusterIP: None
  selector:
    tier: mysql-db
  ports:
    - name: 'mysql-http'
      protocol: 'TCP'
      port: 3306
---
# STATEFUL SET
apiVersion: apps/v1
kind: StatefulSet
metadata:
  name: mysql-statefulset
spec:
  selector:
    matchLabels:
      tier: mysql-db
  serviceName: mysql-statefulset
  replicas: 1
  template:
    metadata:
      labels:
        tier: mysql-db
    spec:
      terminationGracePeriodSeconds: 10
      containers:
        - name: my-mysql
          image: my-mysql:latest
          imagePullPolicy: Always
          args:
            - "--ignore-db-dir=lost+found"
          ports:
            - name: 'http'
              protocol: 'TCP'
              containerPort: 3306
          volumeMounts:
            - name: mysql-pvc
              mountPath: /var/lib/mysql
          env:
            - name: MYSQL_ROOT_USER
              valueFrom:
                secretKeyRef:
                  name: mysql-secret
                  key: mysql-root-username
            - name: MYSQL_ROOT_PASSWORD
              valueFrom:
                secretKeyRef:
                  name: mysql-secret
                  key: mysql-root-password
            - name: MYSQL_USER
              valueFrom:
                configMapKeyRef:
                  name: mysql-config
                  key: mysql-username
            - name: MYSQL_PASSWORD
              valueFrom:
                configMapKeyRef:
                  name: mysql-config
                  key: mysql-password
            - name: MYSQL_DATABASE
              valueFrom:
                configMapKeyRef:
                  name: mysql-config
                  key: mysql-database
  volumeClaimTemplates:
    - metadata:
        name: mysql-pvc
      spec:
        storageClassName: 'mysql-fast'
        resources:
          requests:
            storage: 120Gi
        accessModes:
          - ReadWriteOnce
          - ReadOnlyMany

MySQL存儲(chǔ)類(lèi)清單:

apiVersion: storage.k8s.io/v1
kind: StorageClass
metadata:
  name: mysql-fast
provisioner: kubernetes.io/gce-pd
parameters:
  type: pd-ssd
reclaimPolicy: Retain
allowVolumeExpansion: true
volumeBindingMode: Immediate

為什么Kubernetes嘗試將Pod調(diào)度到內(nèi)存不足的節(jié)點(diǎn)?

更新

我已向MySQL清單添加了請(qǐng)求和限制,以改進(jìn)Qos Class。現(xiàn)在Qos ClassGuaranteed

遺憾的是,Kubernetes仍在嘗試調(diào)度到內(nèi)存不足rnfh節(jié)點(diǎn)。

kubectl describe po mysql-statefulset-0 | grep node -i
Node: gke-cluster-default-pool-rnfh/So.Me.I.P

kubectl describe po mysql-statefulset-0 | grep qos -i
QoS Class: Guaranteed

推薦答案

我又運(yùn)行了幾個(gè)測(cè)試,但無(wú)法復(fù)制。

要正確回答這個(gè)問(wèn)題,我們需要更多的日志。不確定你是否還留著它們。如果我能猜到哪個(gè)是這個(gè)問(wèn)題的根本原因,我會(huì)說(shuō)它與PersistentVolume有關(guān)。

在其中一個(gè)Github issue – Volume was remounted as read only after error #752中,我發(fā)現(xiàn)其行為與OP的行為非常相似。

您已經(jīng)為您的MySQL創(chuàng)建了special存儲(chǔ)類(lèi)。您已設(shè)置reclaimPolicy: Retain,因此未刪除PV。當(dāng)StatefulsetPod(具有相同后綴-0)重新創(chuàng)建(由于連接錯(cuò)誤、數(shù)據(jù)庫(kù)上的一些問(wèn)題而重新啟動(dòng),很難說(shuō))時(shí),它會(huì)嘗試重新認(rèn)領(lǐng)此卷。在提到的Github問(wèn)題中,用戶也有非常相似的情況。也有inode #262147: comm mysqld: reading directory lblock問(wèn)題,但在下面也有條目[ +0.003695] EXT4-fs (sda): Remounting filesystem read-only。可能在重新裝載時(shí)更改了權(quán)限?

您的volumeClaimTemplates包含的另一件事

        accessModes:
          - ReadWriteOnce
          - ReadOnlyMany

因此,一個(gè)PersistentVolume可以被一個(gè)節(jié)點(diǎn)用作ReadWriteOnce,也可以被多個(gè)節(jié)點(diǎn)僅用作ReadOnlyMany。有可能使用Read-Only評(píng)估模式在不同節(jié)點(diǎn)中重新創(chuàng)建POD。

[ +35.912075] EXT4-fs warning (device sda): htree_dirblock_to_tree:977: inode #2: lblock 0: comm mysqld: error -5 reading directory block
[  +6.294232] EXT4-fs error (device sda): ext4_find_entry:1436: inode #262147: comm mysqld: reading directory lblock ...
[  +0.005226] EXT4-fs error (device sda): ext4_find_entry:1436: inode #2: comm mysqld: reading directory lblock 0
[  +1.666039] EXT4-fs error (device sda): ext4_journal_check_start:61: Detected aborted journal
[ +0.003695] EXT4-fs (sda): Remounting filesystem read-only

它適合OP的評(píng)論:

兩天前,由于我不知道的原因,Kubernetes重新啟動(dòng)了容器,并一直嘗試在rnfa機(jī)器上運(yùn)行它。容器可能已從另一個(gè)節(jié)點(diǎn)逐出。

另外,可能會(huì)更新節(jié)點(diǎn)或群集(取決于是否打開(kāi)了自動(dòng)更新選項(xiàng)),這可能會(huì)強(qiáng)制重新啟動(dòng)Pod。

'/var/lib/mysql/': Input/output error問(wèn)題可能指向數(shù)據(jù)庫(kù)損壞,如前面提到的here。

通常,該問(wèn)題已由cordoning受影響的節(jié)點(diǎn)解決。有關(guān)cordondrain之間差異的其他信息,請(qǐng)參閱here。

與添加一樣,要將實(shí)例分配給特定節(jié)點(diǎn)或具有指定標(biāo)簽的節(jié)點(diǎn),可以使用Affinity

這篇關(guān)于GKE Kubernetes MySQL輸入/輸出錯(cuò)誤Ext4Error的文章就介紹到這了,希望我們推薦的答案對(duì)大家有所幫助,

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標(biāo)簽:errorGKEKubernetesMySQLInput/outputerrorExt4Error exception google-cloud-p
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