【ITBEAR】中國農業科學院深圳農業基因組研究所的周永鋒團隊近日在《自然?遺傳學》上發表了一項重大研究成果,他們利用人工智能技術成功提升了葡萄育種的效率與精準度。
該研究通過構建全面的葡萄泛基因組,并結合機器學習算法,實現了對葡萄農藝性狀的高準確度預測,預測準確率高達85%。相較于傳統的育種方法,新技術能夠將育種周期大幅縮短,并提高育種效率達400%,為葡萄品種的快速創新奠定了堅實基礎。
周永鋒團隊自2015年起便專注于葡萄的設計育種研究。在2023年,他們發布了首個葡萄端粒到端粒的完整參考基因組圖譜,該成果被《園藝研究》雜志選為封面文章。然而,團隊并未止步于此,他們進一步對多個葡萄品種進行了測序與組裝,構建出了目前最全面、最準確的葡萄泛基因組Grapepan v1.0。
為了深入探究葡萄基因與性狀之間的關聯,周永鋒團隊從大量葡萄品種中精心選取了400多份代表性樣本,進行了連續三年的農藝性狀調查。通過數量遺傳學分析,他們成功鑒定出148個與農藝性狀顯著相關的位點,其中122個為首次發現。這一發現為理解葡萄性狀的遺傳基礎提供了重要線索。
在擁有全面、準確的基因組數據的基礎上,周永鋒團隊進一步引入了機器學習技術。他們利用訓練數據集構建了葡萄全基因組選擇模型,并通過驗證集對模型進行了優化。最終,測試數據集顯示,該模型的預測性能出色,準確率高達85%。
這一模型的建立,使得育種家能夠在葡萄幼苗時期就預測出其成熟后的性狀,從而及時剔除不符合條件的幼苗,大幅減少了育種過程中的人工成本和投入。這一技術的成功應用,不僅提高了葡萄育種效率,也為其他多年生作物的育種提供了有力的方法參考。
目前,周永鋒團隊的相關研究成果已經申請并獲批了多項國家發明專利,同時還申請了國際專利,充分展示了該技術在葡萄育種領域的廣闊應用前景。