近日,國家基因庫生命大數據平臺(CNGBdb)獲得多家國際出版機構/期刊認可:獲Wiley、Oxford出版集團和PeerJ出版社認可;獲Science系列期刊認可,符合SAGE期刊投稿需求。這是CNGBdb在國際認可方面繼被愛思唯爾(Elsevier)收錄為組學數據歸檔庫,成為地球生物基因組計劃(EBP)推薦存儲庫之后的又一重大進展,標志著CNGBdb組學數據標準和數據庫體系在國際認可方面邁上新臺階。全球科研人員在以上國際期刊/出版機構旗下期刊投稿,可以選擇CNGBdb歸檔并共享科研數據。
國家基因庫生命大數據平臺(CNGBdb)是一個為全球科研工作者提供生物大數據匯交管理和共享使用等服務的平臺。截至目前,已歸檔3721個研究項目,多組學數據量達6612TB,支撐全球近300個科研單位的科研數據匯交和共享。
上圖:國家基因庫生命大數據平臺(CNGBdb)
目前,CNGBdb已獲得國際主流出版機構/期刊、重大國際合作項目的認可:已通過FAIRsharing認證,被國際科研數據倉儲目錄re3data收錄;被學術出版業巨頭Elsevier收錄為指定歸檔庫;獲得全球科研和教育領域的領導者Wiley、全球規模最大的大學出版社之一Oxford出版集團和全球領先的開放學術出版商之一PeerJ出版社認可;獲得Science系列期刊認可,符合SAGE期刊投稿需求;被全球性項目——地球生物基因組計劃(Earth BioGenome Project,EBP)指定為數據存儲庫。此外,遞交到CNGBdb的數據統一進行DOI(數字對象標識符)標識,促進共享和利用。
CNGBdb的存儲功能由國家基因庫序列歸檔系統(CNSA)負責。CNSA是一個歸檔全球組學數據的系統,致力于多組學數據(基因組、轉錄組、代謝組、單細胞和空間轉錄組等)的存儲、管理和共享,促進組學數據的再利用,推動生命科學的發展,為國內科研人員提供更加安全、規范、可靠、便捷、開放的數據歸檔系統。
上圖:國家基因庫序列歸檔系統(CNSA)
截至2021年12月29日,CNSA已支持論文發表351篇,發表期刊183種,包括The Lancet、Science、Cell等。
上圖:CNGBdb支持發表雜志
上圖:CNGBdb支撐成果發表實例
2021年中山大學公共衛生學院的舒躍龍團隊在Science期刊發表重大突破:首次發現人MX1基因稀有變異可能增加人感染H7N9禽流感病毒風險。此項研究中全基因組測序數據及其關聯分析的等位基因頻率和匯總統計數據已存儲于國家基因庫生命大數據平臺(CNGBdb),項目編號分別為:CNP0001997和CNP0001481。
未來,CNGBdb將繼續在嚴格保障數據安全的前提下,以切實服務用戶需求為驅動,不斷完善平臺功能,與全球期刊展開深入合作,為全球科研工作者提供更加便捷高效的服務。