??? ?轉錄組基因數據分析是一個非常前衛的IT技術分支,但通過這次的課程,同學們對轉錄組基因數據分析將不再陌生。轉錄組數據分析一般分為所有基因挖掘、差異基因挖掘、表達量挖掘、高級工具挖掘四個步驟,在本次的課程中我們不僅要對轉錄組進行數據分析和挖掘,還對轉錄組技術理論進行了非常深入的研究和探討,更進一步的進行了數據的可視化分析報告,這對于更好的理解以及轉錄組數據分析有更實際的應用。
===============課程目錄===============
(1)\01、轉錄組基礎
├─01、轉錄組基礎(上).mp4
├─02、轉錄組基礎(下).mp4
├─11-轉錄組概述(1).pdf
├─11-轉錄組概述.pdf
(2)\02、Windows下轉錄組分析軟件的安裝
├─01、Windows下轉錄組分析軟件安裝.mp4
├─02、Windows軟件安裝-510.mp4
├─轉錄組數據分析軟件安裝-Windows.zip
(3)\03、Linux下的軟件安裝和一鍵配置轉錄組運行環境
├─01、Linux下軟件安裝和一鍵配置轉錄組運行環境.mp4
├─02、Linux下軟件安裝-510.mp4
├─13-1-轉錄組軟件安裝-Linux(1).pdf
├─13-1-轉錄組軟件安裝-Linux.pdf
(4)\04、轉錄組Salmon分析流程講解
├─01、Salmon基礎.mp4
├─02、Salmon實戰操作.mp4
├─03、Salmon理論-510.mp4
├─04、Salmon實戰-510.mp4
├─12-轉錄組分析流程Salmon(1).pdf
├─12-轉錄組分析流程Salmon.pdf
├─13_salmon_deseq2_go.zip
├─transcriptome_server.zip
(5)\05、DESeq2差異基因分析理論和操作
├─01、DESeq2差異基因分析理論和操作1.mp4
├─02、DESeq2理論-510.mp4
├─03、DESeq2差異基因分析理論和操作2.mp4
├─04、DESeq2實戰-510.mp4
├─14-差異基因分析理論和實戰(1).pdf
├─14-差異基因分析理論和實戰.pdf
(6)\06、GO、KEGG富集分析理論和可視化講解
├─01、GO KEGG富集分析理論和可視化講解.mp4
├─02、GO KEGG msigdb富集分析和可視化實戰.mp4
├─03、GO富集理論-510.mp4
├─04、GO富集操作+Cytoscape_clueGO-510.mp4
├─15_16-GOGSEA富集分析原理和操作(1).pdf
├─15_16-GOGSEA富集分析原理和操作.pdf
├─goeast.txt
(7)\07、利用Cytoscape-clueGO進行富集分析
├─01、Cytoscape富集可視化Pathway通路映射.mp4
├─02、Cytoscape clueGO進行富集分析和網絡可視化.mp4
├─03、Cytoscape理論和pathway-510.mp4
├─25-Cytoscape繪制網路通路圖(1).pdf
├─25-Cytoscape繪制網路通路圖.pdf
├─cytoscape演示數據.zip
├─KEGG.zip
(8)\08、GSEA富集分析理論和可視化案例講解
├─01、GSEA富集分析理論和可視化案例講解(GO、KEGG、MsigDB).mp4
├─02、GSEA兩組樣品和時間序列富集分析.mp4
├─03、GSEA理論-510.mp4
├─04、GSEA實戰-510.mp4
├─15_GSEA.zip
(9)\09、二代和三代高通量測序原理
├─01、二代和三代高通量測序原理.mp4
├─02、中心法則測序應用-510.mp4
├─03、測序原理-510.mp4
├─21-二代測序平臺和原理(1).pdf
├─21-二代測序平臺和原理.pdf
(10)\10、轉錄組STAR比對分析流程講解
├─01、轉錄組STAR比對分析流程講解.mp4
├─02、STAR有參操作解釋-510.mp4
├─03、STAR有參操作總結-510.mp4
├─22-轉錄分析流程STAR(1).pdf
├─22-轉錄分析流程STAR.pdf
(11)\11、轉錄組STAR比對分析實戰與IGV可視化、比對評估、飽和性檢測
├─01、轉錄組STAR比對分析實戰和IGV可視化 比對評估 飽和性檢測.mp4
├─02、IGV可視化-510.mp4
├─23-轉錄組分析流程-IGV(1).pdf
├─23-轉錄組分析流程-IGV.pdf
(12)\12、STAR定量結果差異基因分析和與Salmon結果比較
├─01、STAR定量結果差異基因分析和與salmon結果比較.mp4
├─23_star_deseq2_go.zip
(13)\13、WGCNA理論分析和注意事項、案例解讀
├─01、WGCNA理論-510.mp4
├─02、WGCNA理論分析和注意事項、案例解讀.mp4
├─24-WGCNA共表達網絡分析(1).pdf
├─24-WGCNA共表達網絡分析.pdf
(14)\14、WGCNA共表達實戰
├─01、WGCNA實戰和網絡可視化-510.mp4
├─02、WGCNA共表達實戰.mp4
├─24_WGCNA.zip
(15)\15、轉錄組組裝和可變剪接分析理論和實戰
├─01、轉錄組組裝和可變剪接分析理論和實戰.mp4
├─31-轉錄本拼裝和可變剪接.pdf
(16)\16、無參轉錄組分析理論
├─01、無參轉錄組分析理論.mp4
├─32-無參轉錄組組裝和注釋.pdf
(17)\17、單細胞轉錄組概念
├─01、單細胞轉錄組概念.mp4
├─31-單細胞轉錄組基本概念.pdf
(18)\18、單細胞轉錄組實戰
├─01、10X拆庫瀏覽.mp4
├─02、單細胞轉錄組數據獲取-510.mp4
├─03、seurat-monocle-scater包解釋和運行.mp4
├─32-單細胞轉錄組實戰.pdf
├─33-單細胞轉錄組數據獲取.pdf
(19)\19、PCA、TSNE、單細胞理論和操作
├─01、PCA TSNE理論.mp4
├─02、PCA TSNE單細胞操作.mp4
├─34-PCA和單細胞可視化.pdf
├─PCA_scRNA.zip
(20)\20、常用轉錄組資源數據庫簡介
├─01、常用轉錄組資源數據庫簡介.mp4
├─33-轉錄組案例分析和基因表達資源數據庫.pdf
(21)\21、常見圖形解讀
├─01、常見圖形解讀.mp4
├─02、常見圖形解釋-510.mp4
├─26-轉錄組常用圖形解讀(1).pdf
├─26-轉錄組常用圖形解讀.pdf
(22)\22、AdobeIllustrator修圖和拼圖
├─01、AdobeIllustrator修圖和拼圖.mp4
├─36_AI.zip
├─36論文圖表.pdf
(23)\23、Linux基礎(一)晚間額外課
├─01、Linux基礎 (一)晚間額外課.mp4
├─Linux基礎.zip
├─linux簡介與實操.pdf
(24)\24、Linux基礎(二)晚間額外課
├─01、Linux基礎(二)晚間額外課.mp4
(25)\25、Excel便捷操作
├─01、excel操作-510.mp4
├─Excel.190511.pptx
(26)\26、發表文章相關知識
├─01、發表文章-510.mp4
├─35_發表前準備.pdf
(27)\27、兩周后的答疑
├─01、兩周后的答疑.mp4