近日，華大智造對(duì)超高通量基因測(cè)序儀DNBSEQ-T7的性能進(jìn)行了全面升級(jí)。升級(jí)后，搭配全新高通量測(cè)序試劑盒V3.0，DNBSEQ-T7可實(shí)現(xiàn)更快的測(cè)序速度、更高的測(cè)序通量以及更佳的數(shù)據(jù)表現(xiàn)，全面賦能基因組學(xué)研究。
基于獨(dú)有的DNBSEQ™測(cè)序技術(shù)，華大智造對(duì)DNBSEQ-T7的生化、流體及光學(xué)系統(tǒng)進(jìn)行了全面優(yōu)化，升級(jí)后的DNBSEQ-T7最快可在24小時(shí)內(nèi)生成至少7Tb的數(shù)據(jù)；同時(shí)，對(duì)測(cè)序載片采用了三角形矩陣式信號(hào)位點(diǎn)，在測(cè)序產(chǎn)量方面，將DNBSEQ-T7的有效reads數(shù)提升至少16%（≥5800M），在相同單位面積的測(cè)序載片上實(shí)現(xiàn)了更高密度的數(shù)據(jù)產(chǎn)出。搭配4聯(lián)載片平臺(tái)、高通量測(cè)序試劑盒V3.0并適配華大智造一站式工具包，DNBSEQ-T7每年可測(cè)序超過(guò)14,000個(gè)人類(lèi)全基因組。
早期客戶試用結(jié)果——
客戶坐標(biāo)：北京
應(yīng)用方向：WGS,WES,RNA,科研腫瘤等
“相對(duì)于升級(jí)前的V2.0試劑，使用DNBSEQ-T7高通量測(cè)序試劑套裝V3.0搭配FPGA服務(wù)器，單張芯片測(cè)序平均提升 2.8小時(shí)，兩張芯片同時(shí)測(cè)序平均提升1.8小時(shí)。自建庫(kù)樣本不同產(chǎn)品均達(dá)到測(cè)序深度要求，測(cè)序數(shù)據(jù)分析質(zhì)控均無(wú)異常反饋。”
客戶坐標(biāo)：上海
應(yīng)用方向：WGS,WES,RNA,單細(xì)胞等
“使用華大智造自主研發(fā)的文庫(kù)轉(zhuǎn)化試劑盒（APP-D），測(cè)試第三方文庫(kù)在PE150 測(cè)序模式下40個(gè)run的性能表現(xiàn)，平均測(cè)試結(jié)果表明升級(jí)后的DNBSEQ-T7在 Total Reads（合格標(biāo)準(zhǔn)≥5500M）, Q30和SplitRate等重要指標(biāo)上依舊表現(xiàn)優(yōu)異，其中Q30甚至可以達(dá)到95%（合格標(biāo)準(zhǔn)≥85%）。”
TOTAL READS (M)、Q30 (%) 、SplitRate (%)的run間統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)
TOTAL READS（M）、Q30（%）、SplitRate（%）的run間對(duì)比數(shù)據(jù)
客戶坐標(biāo)：武漢
應(yīng)用方向：WGS,WES,RNA,單細(xì)胞等
“升級(jí)后的DNBSEQ-T7雙barcode DNA樣本測(cè)試結(jié)果顯示Q20、Q30和GC含量等指標(biāo)無(wú)異常情況，滿足質(zhì)控要求。DNBSEQ-T7高通量測(cè)序試劑套裝V3.0和V2.0試劑各文庫(kù)產(chǎn)出比一致，保持在較高的水平，數(shù)據(jù)比對(duì)滿足質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)。”
V3.0測(cè)序試劑質(zhì)控指標(biāo)（Q20、Q30和GC含量等）
客戶坐標(biāo)：石家莊
應(yīng)用方向：WES,WGS
“與官方給出下機(jī)數(shù)據(jù)量及測(cè)序時(shí)長(zhǎng)比較，使用 DNBSEQ-T7 高通量測(cè)序試劑套裝 V3.0，PE150單邊測(cè)序時(shí)長(zhǎng)為22小時(shí)，符合標(biāo)準(zhǔn)22-24小時(shí)。”
結(jié)語(yǔ)
目前基于DNBSEQ-T7平臺(tái)的已發(fā)表文獻(xiàn)超過(guò)270篇，已成功助力各應(yīng)用領(lǐng)域開(kāi)展多項(xiàng)科學(xué)研究，全面推動(dòng)大人群基因組學(xué)、農(nóng)業(yè)基因組學(xué)等領(lǐng)域研究發(fā)展與成果轉(zhuǎn)化。
此次升級(jí)，打造了通量更高、速度更快、數(shù)據(jù)質(zhì)量更佳的DNBSEQ-T7測(cè)序平臺(tái)，可廣泛適用于全基因組測(cè)序、超高深度全外顯子組測(cè)序、表觀基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和腫瘤大Panel基因檢測(cè)等大型基因測(cè)序項(xiàng)目。同時(shí)，DNBSEQ-T7高通量測(cè)序試劑套裝V3.0在大幅提升數(shù)據(jù)產(chǎn)量的基礎(chǔ)上進(jìn)一步為用戶節(jié)約成本。
